PubChem es una base de datos de moléculas químicas y sus actividades en ensayos biológicos, creada en 2004. Es la colección más grande del mundo de información química de acceso gratuito, mantenida por el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) de los Estados Unidos.
Contiene información sobre una amplia gama de moléculas, desde pequeñas moléculas hasta macromoléculas químicamente modificadas.
Organiza sus datos en tres bases de datos principales: Substance, Compound y BioAssay.
Proporciona datos sobre estructuras químicas, propiedades físico-químicas, actividades biológicas, información de seguridad y más.
Ofrece herramientas de búsqueda avanzadas, incluyendo búsqueda por estructura química, nombre, fórmula, peso molecular y otras propiedades.